旅游服务合同中的意思自治原则是指在订立和履行旅游合同时，当事人应当享有充分的自由选择权和决定权，可以根据自己的意愿自主协商合同的条款内容，并在平等自愿的基础上达成协议。这一原则体现了私法自治的精神，即尊重当事人的个人意志和利益，鼓励通过市场机制来实现资源的优化配置。

根据《中华人民共和国民法典》的规定，民事主体从事民事活动，应当遵循自愿原则，按照自己的意思设立、变更、终止民事法律关系。在旅游服务合同中，游客可以选择不同的旅行社和服务项目，而旅行社也可以根据自己的经营策略和成本核算制定相应的价格和服务标准。双方可以在充分了解对方需求和条件的情况下进行谈判，最终形成一份符合双方利益的合同文本。

在实际操作中，为了保障意思自治原则的有效实施，需要注意以下几点：

1. 信息披露义务：旅行社有责任向消费者提供真实、准确、完整的信息，包括行程安排、住宿条件、交通工具等，以便消费者能够做出明智的选择。
2. 格式条款限制：虽然许多旅游合同采用的是格式化的条款，但并不意味着完全剥夺了消费者的权利。如果对格式条款存在异议或者认为不合理，消费者有权要求修改或拒绝接受该条款。
3. 违约责任的约定：合同中应该明确规定双方的违约责任及赔偿方式，确保一旦发生纠纷时，有明确的法律依据来进行处理。
4. 争议解决途径：合同中通常会约定出现争议时的解决方式，如协商、调解、仲裁或诉讼等。这为日后可能出现的分歧提供了有效的解决渠道。

下面是一个结合实际案例来说明上述原则的应用：

某游客王某在网上预订了一个包含往返机票和酒店住宿的旅行套餐。但在出发前两天，航空公司通知航班取消，导致王某无法按原计划出行。由于事出紧急且无其他合适替代方案，王某只能重新购买高价机票并调整行程。事后，他向旅行社提出索赔要求，理由是旅行社未能妥善处理航班变动带来的影响。

根据意思自治的原则，本案中涉及到两个关键点：一是旅行社是否尽到了及时告知和协助改签的责任；二是旅行社是否事先与消费者就此类突发事件的应对措施进行了明确约定。如果旅行社没有及时通知消费者关于航班的变动情况，也没有采取积极行动帮助消费者寻找替代解决方案，那么显然违反了意思自治的原则。反之，如果旅行社已经事先在合同中约定了类似情况下双方的权利义务以及可能的补偿措施，那么就可以依据合同约定来解决争端。

综上所述，旅游服务合同中的意思自治原则既是对消费者权益的保护，也是对市场竞争秩序的维护。它要求各方在进行交易时要保持诚实守信、公平合理的态度，并且在出现问题时能以契约精神为基础寻求解决之道。只有这样，才能真正实现旅游服务的健康发展和消费者的满意体验。